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科学家已经绘制了人类和病毒蛋白之间的相互作用图

2020-07-12 14:40:40 来源:网络 阅读:
  美国哥伦比亚大学(Columbia University)的研究人员开发了一个计算框架,用以推断病毒蛋白与人类蛋白质之间的相互作用,利用这种方法获得大量关于病毒如何感染人类的信息,并绘制出所有已知的人类病毒与受感染细胞之间的相互作用图。这篇论文发表在最近一期的"细胞"(Cell)杂志上。
  病毒是细胞中的一种寄生微生物,它通过蛋白质之间的相互作用利用细胞机制,而细胞也依赖这种作用来激活免疫反应机制来处理病毒入侵,因此,了解蛋白质之间的相互作用对于了解病毒与宿主细胞之间的关系是非常重要的。
  目前,科学家主要采用高通量的方法来研究蛋白质之间的相互作用。虽然已有许多新的发现,但这种方法的可扩展性不足也限制了这项研究。这一次,哥伦比亚大学研究人员P/Hister开发的计算框架利用蛋白质结构信息来推断病毒蛋白与人类蛋白质之间的相互作用,从而有效地弥补了高通量方法缺乏扩展性的不足。
  通过P/HIPster,研究人员研究了1000多种已知的人类病毒及其编码的大约13000种蛋白质,并最终绘制了人类与病毒蛋白之间的相互作用图。该图谱涵盖了大约282000对相互作用的蛋白质对,所揭示的生物信息对于人类免疫学和传染病的研究具有重要价值。
  除了证实人类与病毒蛋白的相互作用外,P-hester还帮助研究人员获得了许多关于病毒如何感染人类细胞和引起疾病的信息,包括雌激素受体在调节寨卡病毒感染中的作用、人类乳头瘤病毒如何引起癌症、病毒如何影响人类基因组等。
  研究人员说,科学家们对病毒蛋白和人类蛋白质之间的相互作用没有很深的理解,希望新地图将为科学界提供更多的研究资源,并帮助科学家获得更多的生物信息。接下来,他们计划将P-hester用于更复杂的病原体,如寄生虫和细菌;在未来,他们可能会使用这一工具来研究影响作物或牲畜的病毒或病原体。